INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS

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Excelência em Ensino e Pesquisa

Profa. Dra. Patricia Pereira Coltri

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Nome: Patricia Pereira Coltri Telefone: 3091-0980 E-mail: coltri@usp.br Currículo Lattes: http://lattes.cnpq.br/4777447588508123 Site do laboratório: www.coltri.bio.br

Linha(s) de Pesquisa

Regulação do splicing em eucariotos Em nosso laboratório, investigamos a regulação do splicing em eucariotos. O controle da expressão gênica depende de um extenso processamento dos RNAs. A maioria dos genes é composta por sequências que permanecem no RNA maduro (os exons) e por sequências intermediárias, os introns. O splicing é o processo de remoção de introns e ligação de exons em sequências maduras. Estes RNAs podem ser direcionados para tradução ou realizar outras funções nas células. Este processo é realizado por uma complexa maquinaria, composta por RNAs e proteínas, denominada spliceossomo. Além dos RNAs, muitas proteínas participam do spliceossomo de forma transitória, e atuam como fatores regulatórios. Para estudar a regulação do processo de splicing, investigamos quais os mecanismos que podem guiar e direcionar o complexo spliceossomo para diferentes transcritos de RNA. Estamos interessados em compreender como a atividade do complexo é modulada por diferentes proteínas, e também por sequências específicas nos transcritos precursores de RNA. Para isso, são utilizadas técnicas de biologia molecular e celular.

Principais Publicações

  1. Coltri, P. P., Oliveira, C. C. 2012. Cwc24p is a general Saccharomyces cerevisiae splicing factor required for the stable U2 snRNP binding to primary transcripts. PLoS One v.7, p. e45678
  2. Morello, L. G., Coltri, P. P., Quaresma, A. J. C., Simabuco, F. M., Silva, T. C. L., Singh, G., Nickerson, J. A., Oliveira, C. C., Moore, M., Zanchin, N. I. T. 2011. The Human Nucleolar Protein FTSJ3 Associates with NIP7 and Functions in pre-rRNA Processing. PLoS One v.6, p. e29174.
  3. Coltri, P., Effenberger, K., Chalkley, R., Burlingame, A., Jurica, M. 2011. Breaking Up the C Complex Spliceosome Shows Stable Association of Proteins with the Lariat Intron Intermediate. PLoS One v. 6, p. e19061.
  4. Morello, L. G., Hesling, C., Coltri, P.P., Castilho, B.A., Rimokh, R., Zanchin, N.I.T. 2011. The NIP7 protein is required for accurate pre-rRNA processing in human cells. Nucleic Acids Research, 39(2):648-665.
  5. Luz, J.S., Ramos, C.R.R., Santos, M.C.T., Coltri, P.P., Palhano, F.L., Foguel, D., Zanchin, N.I.T., Oliveira, C.C. 2010. Identification of archaeal proteins that affect the exosome function in vitro. BMC Biochemistry, v. 11, p. 22.
  6. Coltri, P.P., Guimarães, B.G., Granato, D.C., Luz, J.S., Teixeira, E.C., Oliveira, C.C., Zanchin, N.I.T. 2007. Structural Insights into the Interaction of the Nip7 PUA Domain with Polyuridine RNA. Biochemistry, v. 46, p. 14177-14187.
  7. Coltri, P.P., Rosato, Y.B. 2005. Transcription analysis of pilS and xpsEL genes from Xylella fastidiosa. Antonie van Leeuwenhoek, v. 87, n. 3, p. 253-257.
  8. Coltri, P.P., Rosato, Y.B. 2004. Regulation of the htpX Gene of Xylella fastidiosa and Its Expression in E. coli. Current Microbiology, v. 48, n. 6, p. 391-395.
  9. Coltri, P.P., Guimarães, B.G., Oliveira, C.C., Zanchin, N.I.T. 2004. Expression, crystallization and preliminary X-ray analysis of the Pyrococcus abyssi protein homologue of Saccharomyces cerevisiae Nip7p. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography, v. 60, p. 1925-1928.
  10. Coltri, P.P., Gonçalves, E.R., Rosato, Y.B. 2000. Detecção da diversidade genética em Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae por SDS-PAGE, RAPD e RFLP da região espaçadora 16S-23S. Summa Phytopathologica, v. 26, n. 4, p. 399-406.